Förbundsstämman
BRs högsta beslutande organ är Förbundsstämman, som äger rum en gång per år. Stämman består av 75 valda ombud från hela landet, som beslutar om förbundets ekonomi, övergripande mål och verksamhet samt utser förbundsstyrelse och revisorer. Detta finns reglerat i BRs stadgar.
Styrelse och kansli
Styrelsen har för närvarande nio ledamöter och tre suppleanter. De representerar bussföretag av olika storlek, med olika verksamhet och geografiskt spridda över landet. Styrelsen har till sitt förfogande ett centralt kansli, beläget i Stockholm. Kansliet leds av en förbundsdirektör.
Regionala föreningar
Basen för BRs verksamhet är det arbete som utförs - ofta ideellt - i de 11 regionala bussbranschföreningarna. Föreningarna fungerar som BRs förlängda arm och driver branschfrågor på ett regionalt och lokalt plan. Varje branschförening är i sig en självständig organisation, som utformar sina egna hadlingsprogram inom ramen för de stadgar och riktlinjer som BRs förbundsstämma fastställt.